Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim23Q8BGX0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim23Q8BGX0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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