Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms