Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc50Q810U5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms