Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stkld1Q80YS9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms