Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nrde2Q80XC6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrde2Q80XC6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms