Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SnupnQ80W37 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SnupnQ80W37 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SnupnQ80W37 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms