Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NischQ80TM9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NischQ80TM9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
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