Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms