Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms