Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms