Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp397Q7TNK4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms