Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ScocQ78YZ6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms