Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TwistnbQ78WZ7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms