Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme8Q715T0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms