Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms