Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd3Q6ZQK0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms