Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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