Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc44a1Q6X893 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms