Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp8b3Q6UQ17 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms