Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms