Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cachd1Q6PDJ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms