Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg2aQ6P4T0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms