Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm2bQ6P1G2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm2bQ6P1G2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms