Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slx4Q6P1D7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slx4Q6P1D7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms