Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpbp1Q6NXH3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms