Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc3bQ6NWW9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fndc3bQ6NWW9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms