Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SphkapQ6NSW3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SphkapQ6NSW3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms