Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcd11Q6NS46 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms