Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mvb12bQ6KAU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms