Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arhgap20Q6IFT4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms