Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nckap5lQ6GQX2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nckap5lQ6GQX2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms