Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scaf8Q6DID3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf8Q6DID3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms