Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smarca2Q6DIC0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms