Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rftn1Q6A0D4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms