Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms