Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk13Q69ZA1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk13Q69ZA1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms