Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn4Q69Z26 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn4Q69Z26 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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