Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9aQ68FE2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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