Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltcQ68FD5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CltcQ68FD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms