Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VclQ64727 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VclQ64727 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VclQ64727 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VclQ64727 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VclQ64727 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms