Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sdc3Q64519 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc3Q64519 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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