Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PtprdQ64487 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprdQ64487 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PtprdQ64487 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms