Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcg1Q64343 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms