Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms