Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vat1Q62465 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms