Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcncQ62447 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcncQ62447 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms