Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sp4Q62445 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms