Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SypQ62277 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SypQ62277 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SypQ62277 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SypQ62277 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SypQ62277 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SypQ62277 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SypQ62277 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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