Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sall3Q62255 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sall3Q62255 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms