Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms